猪流行性腹泻病毒的分离及其M基因的生物信息学分析

• 作者: 代振江 刘钊 曾智勇 梁海英 汤德元 王伟丞
• 来源期刊: 贵州农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: PEDV M蛋白 变异 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 28-30
• 页数: 3页
• 分类号: S828
• 字数: 2237字
• 语种: 中文

摘要

为了解贵州猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的变异情况,对分离PEDV的M基因进行了克隆测序和生物信息学分析.结果表明:分离的PEDV株(用N-GZ表示)与贵州省动物疫病研究室曾报道的PEDV株(用GZ表示)位于同一进化分支,与疫苗株CV777处于不同进化分支.N-GZ株与GZ株M基因的核苷酸序列相似性为98.5％,表明其亲缘关系较近,与CV777疫苗株的亲缘关系稍远.多重比较发现,N-GZ株与CV777株M蛋白的抗原表位区存在3个氨基酸的差异,与GZ株相比存在2个氨基酸的突变.M基因是PEDV的保守基因,但N-GZ株M基因在抗原表位区存在一定程度突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤德元	贵州大学动物科学学院	256	1165	16.0	26.0
2	曾智勇	贵州大学动物科学学院	205	619	12.0	17.0
3	刘钊	贵州大学动物科学学院	40	80	5.0	7.0
4	代振江	贵州大学动物科学学院	26	57	3.0	6.0
5	梁海英	贵州大学动物科学学院	53	98	6.0	8.0
6	王伟丞		6	36	3.0	6.0