云南蔗区甘蔗线条花叶病毒分离物NIa基因形成新簇

• 作者: 李世访 李文凤 贺振
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 甘蔗线条花叶病毒 NIa基因 系统发生
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1802-1810
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20160123

摘要

[目的]利用NIa基因,阐明甘蔗线条花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)的种系发生关系,为预测SCSMV流行变异趋势及科学防控提供理论依据.[方法]从云南蔗区和国家甘蔗种质资源圃采集感病样品,RT-PCR扩增获得SCSMV NIa基因序列后,使用Splits Tree、RDP、PhyML、DnaSP等软件分析SCSMV中国分离物的系统发生、选择压力及基因流动等特征.[结果]共获得23条SCSMV NIa基因序列.这些序列间未发生重组,云南蔗区的部分序列形成1个新簇,且云南蔗区与国家甘蔗种质资源圃之间的基因交流不显著.此外,选择压力分析表明,NIa基因受很强的负选择压力作用.[结论]与P1、HC-Pro和CP等基因类似,SCSMV在NIa基因上也包含5个簇;SCSMV云南分离物具有较高的遗传多样性和清晰的地理相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李世访	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	50	364	11.0	16.0
2	贺振	扬州大学园艺与植物保护学院	25	48	4.0	6.0