一种侵染Cladosporium cladosporioides的新病毒研究

• 作者: 喻镇东 喻静 姜晓龙 许伟 金磊磊 陈辉辉 陈集双
• 来源期刊: 科技通报
• 学科: 生物学
• 关键词: dsRNA 5'UTR 系统进化树分析 双分病毒属
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 75-78
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 2433字
• 语种: 中文

摘要

在1株污染半夏组培苗的枝状枝孢真菌(Cladosporium cladosporioides DF15)中检测到5条双链RNA(double-strand RNA,dsRNA)条带.通过M-SPAT(modified single-primer amplification technique)、克隆测序获得5条dsRNA的序列信息,分别为dsRNA1(2434bp)、dsRNA2(2241bp)、dsRNA3(2008bp)、dsRNA4(1261bp)和dsRNA5(942bp).经Blast比对,dsRNA1编码蛋白的氨基酸序列与侵染荚孢壳科、球腔菌科真菌的双分病毒属(Partitivirus)病毒,以及侵染辣椒等植物的双分病毒科(Partitiviridae)病毒的依赖于RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)序列相似度最高.氨基酸序列系统进化树分析表明,dsRNA1与侵染真菌的双分病毒属病毒亲源关系更近.通过核苷酸序列5'非编码区(untranslated regions,UTR)的比对发现,5条dsRNA的5'UTR序列相似度高达50.0%~95.3%,并含有2段保守序列5'-GUAAAUAAACCUU-3'和5'-C(/G)TA(/AG)CAAGT(/C)AT-3'.根据上述分析,推测5条dsRNA序列来自同1种病毒基因组,并且为侵染C. cladosporioides的1种新双分病毒科双分病毒属病毒,命名该病毒为C. cladosporioides virus 1.