中国新疆小反刍兽疫病毒F基因序列分析

• 作者: 刘学锋 刘永宏 曹胜波 李岳洋 王海国 蒋秀梅 赵丽 马世强 马海璐
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中国 新疆 小反刍兽疫 F基因
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 328-334
• 页数: 7页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4270字
• 语种: 中文

摘要

为分析中国新疆小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株分子演变特点和疫情传播路线,从GenBank数据库下载所有国家全部的PPRV F基因全序列,应用DNAStar软件,结合疫情毒株时空分布进行序列分析.结果显示,中国新疆PPRV株F基因全序列,与2014年小反刍兽疫情中河南和北京毒株核苷酸的同源性最高,为99.8％～99.9％,与中国西藏3个毒株核苷酸的同源性为97.7％,与中国采用的疫苗株核苷酸同源性为92.9％,核苷酸同源性最低的是肯尼亚毒株,与国外毒株核苷酸同源性最高的是印度毒株.F基因系统进化关系分析显示,中国新疆PPRV株属于基因Ⅳ系.F蛋白氨基酸同源性结果显示,除与科特迪瓦1989年毒株ICV89氨基酸同源性最低外,与其他氨基酸同源性比对结果均与核苷酸的比对结果一致.中国新疆PPRV株存在一定程度的变异,可能是由周边国家传人.