SNP位点rs6983267相关非编码RNAG／U对结肠癌细胞转移活性的影响

• 作者: 孟晨雪 沈阳丽 田洁 蔡文臣 郝小惠 郭志义
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠肿瘤 肿瘤转移 单核苷酸多态性 rs6983267 非编码基因
• 年，卷（期）: 2016,（45）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 9-11
• 页数: 3页
• 分类号: R735.35
• 字数: 2399字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2016.45.003

摘要

目的：探讨染色体8q24区域中单核苷酸多态性（SNP）位点 rs6983267相关非编码 RNA G／U 对结肠癌细胞转移活性的影响。方法运用生物信息学方法分析 SNP rs6983267位点的非编码 RNA；收集 KM12C 和KM12SM细胞，提取细胞总 RNA，逆转录和 PCR 扩增，片段回收后用 Tsp45Ⅰ进行酶切，对酶切（酶切组）和不做酶切（对照组）的模板做 PCR 扩增分析。通过限制性内切酶-PCR 方法检测两组 SNP rs6983267位点的非编码 RNA G／U 相对表达量；KM12C 和 KM12SM细胞分别进行 pGL3-Gs-LUC（pGL3-Gs-LUC 组）、pGL3-Ts-LUC（pGL3-Ts-LUC组）和 pGL3-Basic-LUC 质粒转染，应用双荧光素酶报告基因方法检测两组 KM12C 和 KM12SM细胞中 rs6983267非编码 RNA 启动子活性。结果 ENCODE 数据库显示，染色体8q24区域 SNP rs6983267位点附近存在非编码基因。KM12C 细胞中酶切组、对照组 SNP rs6983267位点相关非编码 RNA G／U 为0．80±0．10、5．60±1．30，KM12SM细胞中分别为0．71±0．09、1．43±0．11。与对照组比较，KM12C 细胞中酶切组 SNP rs6983267位点相关非编码 RNA G／U 差异无统计学意义（P ﹥0．05），KM12SM细胞中升高（P ＜0．05）。KM12C 细胞中，pGL3-Gs-LUC 组、pGL3-Ts-LUC 组 rs6983267位点相关 G 型与 T 型非编码 RNA 启动子相对活性分别为0．81±0．14、0．82±0．25，KM12SM细胞中分别为1．00±0．26、1．85±0．58。在 KM12SM细胞中，两组比较，P ＜0．05；在 KM12C 细胞中，两组比较，P ﹥0．05。结论 SNP rs6983267位点相关非编码 RNA G／U 可能与结肠癌细胞的转移活性相关。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝小惠	华北理工大学医学实验研究中心	12	35	5.0	5.0
2	郭志义	华北理工大学医学实验研究中心	7	16	2.0	4.0
3	蔡文臣	华北理工大学医学实验研究中心	3	2	1.0	1.0
4	沈阳丽	华北理工大学医学实验研究中心	3	2	1.0	1.0
5	孟晨雪	华北理工大学医学实验研究中心	2	2	1.0	1.0
6	田洁	华北理工大学医学实验研究中心	2	2	1.0	1.0