番茄转录因子基因SlYAB2a的克隆、表达及亚细胞定位分析

• 作者: 秦娟 胡廷章 陈再刚 黄小云
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 SlYAB2a 基因克隆 表达分析 亚细胞定位
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 页码范围: 76-82
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|S641.03
• 字数: 5071字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.06.012

摘要

为了研究番茄SlYAB2a基因的功能及其在番茄生长发育中的分子机理,以番茄的cDNA为模板,利用RT-PCR技术从番茄中克隆到SlYAB2a基因,该基因编码的蛋白质由192个氨基酸残基组成,蛋白质的分子量为21.35kDa,等电点是8.79,平均亲水系数是-0.487.SlYAB2a蛋白质的6～ 165位氨基酸残基形成Pfam:YABBY结构域,在20 ～47位有1个C2C2锌指结构域,在122～ 181位有1个螺旋-环-螺旋结构域.二级结构分析表明SlYAB2a蛋白分子中,α-螺旋占19.79％、β-折叠占14.06％、其余66.15％为不规则卷曲.蛋白多序列比对表明SlYAB2a与马铃薯、林烟草、酿酒葡萄、大豆、拟南芥、甘蓝型油菜、花药野生稻、玉米和小麦YABBY2的一致性分别为98％,78％,71％,65％,64％,64％,58％,57％,57％,说明SlYAB2a蛋白与来源于双子叶植物的YABBY2一致性较高,而与来源于单子叶植物的一致性较低.通过聚类分析发现YABBY2蛋白明显分为单子叶和双子叶2个亚类,SlYAB2a蛋白属于双子叶亚类,与马铃薯、潘那利番茄、绒毛状烟草、林烟草等的YABBY2蛋白序列亲缘关系较近.实时定量RT-PCR分析结果表明,在番茄植物的不同生长发育时期,根、茎、叶、花、果实中,都有SlYAB2a基因表达;并且在花和青熟果实中,SlYAB2a基因表达水平远远高于其他组织.说明SlYAB2a基因在花和果实的发育过程中起着重要作用.洋葱表皮细胞瞬时表达结果表明SlYAB2a蛋白定位于细胞核中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡廷章	重庆三峡学院生命科学与工程学院	73	625	15.0	23.0
2	黄小云	重庆三峡学院生命科学与工程学院	36	223	8.0	13.0
3	陈再刚	重庆三峡学院生命科学与工程学院	19	110	6.0	10.0
4	秦娟	重庆三峡学院生命科学与工程学院	5	9	2.0	3.0