湿疹患儿肠道菌群高通量测序初步探索

• 作者: 李萍 王和平 王玉蕾 邓继岿 郑跃杰
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肠道菌群 儿童湿疹 菌群结构 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 751-755
• 分类号: R758.23
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201607002

摘要

目的 为了解湿疹患儿肠道菌群的结构与湿疹之间的关系,通过对湿疹患儿和健康儿童粪便样本细菌总DNA提取,利用高通量测序技术,比较健康儿童和湿疹患儿肠道菌群的异同.方法 10例年龄在2个月～2岁婴幼儿由皮肤科门诊确诊为湿疹伴有过敏性疾病家族史作为研究对象,年龄和性别相当健康儿童10例作为对照,分别收集其粪便标本并提取所有样本中细菌的总DNA,对16S rRNA基因进行高通量测序,获得两组的肠道菌群结构数据并进行菌群差异性分析.结果 通过Roche 454高通量测序,两组肠道微生物菌群多样性指数比较差异无统计学意义.两组主要由Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门)、Proteobacteria(变形菌门)和Actinobacteria(放线菌门)4个门组成;两组在门水平上进行菌群结构比较,差异无统计学意义.两组样本在属水平上共获得200个不同属的细菌,其中Bacillus(芽孢杆菌属)、Bilophila(噬胆菌属)、Christensenella(纺锤状细菌属)、Coprobacillus、Eikenella(艾肯菌属)、Enterobacter(肠杆菌属)、Eubacterium(真杆菌属)、Lactococcus(乳球菌属)、Megamonas(巨单胞菌属)、Leuconostoc(明串珠菌属)、Morganella(摩根菌属)、Rhizobacter(根杆菌属)、Proteus(变形菌属)、Sutterella(萨特菌属)、Veillonella(韦荣球菌属)、Akkermansia、Anaeroglobus、Anaerotruncus、Butyricicoccus、Epulo piscium、Gordonibacter、Lachnospiraceae uncultured、Robinsoniella和Varibaculum共24个属在两组间差异具有统计学意义.结论 湿疹患儿肠道菌群与健康儿童相比,菌群多样性指数(Shannon指数和Simpson指数)未见明显差异,但在菌群结构上发生了一些变化,某些特别的细菌菌属存在显著性差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑跃杰		165	1350	19.0	28.0
2	邓继岿		60	490	13.0	19.0
3	王和平		27	189	9.0	12.0
4	李萍		32	91	5.0	8.0
5	王玉蕾		5	45	3.0	5.0