陕西省部分地区猪流行性腹泻病毒 S、M 和N 基因的遗传变异分析

• 作者: 付明哲 何亚鹏 庞文静 张琪 许信刚 郭抗抗
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S 基因 M 基因 N 基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 25-30
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 5245字
• 语种: 中文

摘要

为了解陕西省部分地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传和变异情况，采集陕西省部分地区规模化猪场的5份疑似 PEDV 感染的猪小肠内容物，进行 PEDV S、M 和 N 基因的 RT-PCR 扩增，并对扩增产物进行序列测定和遗传变异分析。结果表明，5份病料均能扩增出 PEDV S、M 和 N 基因，5株病毒分别命名为 SX-SL、SX-BJ、SX-YL、SX-WN 和 SX-HZ 株。序列分析表明，5株毒株之间的 S、M 和 N 基因核苷酸序列的同源性分别为96．7％～99．8％、98．4％～100％和97．2％～99．9％；氨基酸序列的同源性分别为97．4％～99．9％、98．2％～100％和98．2％～100％。该5株病毒与中国疫苗株 CV777的 S、M 和 N 基因核苷酸序列的同源性分别为93．9％～99．8％、98．1％～100％和95．3％～99．9％，氨基酸序列的同源性为93．6％～99．9％、96．2％～100％和98．2％～100％。遗传进化分析结果显示，5个陕西分离株的 S 基因与中国疫苗株 CV777亲缘关系较远，与近年来中国株、日本株以及韩国株亲缘关系较近。SX-SL 株、SX-BJ 株和 SX-YL 株的 M 和 N 基因与中国疫苗株 CV777亲缘关系较近，且与中国株 CHGD-01亲缘关系密切。SX-WN 株和 SX-HZ 株的 M 和 N 基因与中国疫苗株 CV777亲缘关系较远。该5株病毒的 S 基因以及 SX-WN 株和 SX-HZ 株的 M 基因和 N 基因变异程度较大，而 SX-SL 株、SX-BJ 株和 SX-YL 株三个流行株均与中国株 CHGD-01亲缘关系密切，并且与近年在陕西省流行的 PEDV 也不完全相同。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许信刚	西北农林科技大学动物医学院	116	501	10.0	14.0
2	郭抗抗	西北农林科技大学动物医学院	109	484	12.0	16.0
3	张琪	西北农林科技大学动物医学院	75	218	9.0	11.0
4	付明哲	西北农林科技大学动物医学院	94	346	10.0	14.0
5	何亚鹏	西北农林科技大学动物医学院	20	41	4.0	5.0
6	庞文静	西北农林科技大学动物医学院	8	16	3.0	3.0