鹅细小病毒HN株的分离鉴定及全基因组序列分析

• 作者: 叶保国 张艳 曹宗喜 林哲敏 谭树义 贺冬梅 陈朝喜
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 鹅细小病毒 分离鉴定 全基因组 IRT NS1 VP1
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 13-18
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 3602字
• 语种: 中文

摘要

为研究鹅细小病毒（GPV）基因遗传变异特征，采集海南某养鹅场疑似鹅细小病毒感染的病料，将其处理后接种番鸭胚成功分离到一株病毒，经 PCR 鉴定为鹅细小病毒，命名为 HN 株，并获得了其全基因组序列，将该序列与 GenBank 数据库中登录的16条鹅和番鸭细小病毒基因序列进行了比对分析。结果显示，该株病毒基因组全长为5106 bp，由 ITR、NS、VP 构成，其中 ITR 为444 bp，NS1为1844 bp，VP1为2199 bp；HN 株与 SHFX1201株的 NS1基因和 VP1同源性最高，分别达到99．8％和99．7％，与番鸭细小病毒株 FM 的 NS1基因同源性最低，为82．7％；与90-0215株 VP1同源性最低，为80．1％。HN 株的遗传进化树可以看出，GPV 可以分成明显的2个基因亚群，HN 株与鹅细小病毒匈牙利株（B）、欧洲疫苗株（VG32／1）和台湾株（82-0321V、82-0321、06-0329）均处在第 I 亚群，且与安徽分离株 Y 株以及 SHFX1201株同源性最接近，番鸭源匈牙利株 FM 单独处于第Ⅱ亚群。本研究丰富了 GPV 的数据资料，为研究 GPV 分类地位以及遗传进化关系提供了依据，同时也为研究 GPV 流行趋势和疫苗的开发奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谭树义	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	35	96	3.0	9.0
2	陈朝喜	西南民族大学生命科学与技术学院	45	119	7.0	8.0
3	叶保国	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	40	79	5.0	6.0
4	张艳	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	42	74	3.0	5.0
5	林哲敏	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	57	89	4.0	6.0
6	贺冬梅	海南省农业科学院畜牧兽医研究所	5	4	1.0	1.0