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犬细小病毒河南株的分离鉴定及全基因组序列分析
犬细小病毒河南株的分离鉴定及全基因组序列分析
作者:
唐磊
孙浩杰
张弛
张楠
张百惠
秦亚
蔡亚南
魏战勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
犬细小病毒
分离鉴定
全基因组测序
序列分析
河南省
摘要:
为了研究河南省当前犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)的流行情况,收集经CPV胶体金试纸检测阳性的病犬血便病料,对其处理后进行特异性PCR扩增,然后将粪便处理物经滤器过滤后接种于F81细胞,进行细胞盲传并观察细胞的病变情况,同时对病毒进行理化性质及血凝试验等检测,最后对病毒的全基因组进行测序.结果表明,该病毒经特异性PCR扩增初步鉴定为CPV,接种于F81细胞盲传2代后,出现明显细胞病变.全基因组测序显示,该病毒分离株基因组全长5052 bp,其中包含U型发卡结构188 bp,Y型发卡结构120 bp.此外,其ORF1全长2007 bp,能够编码非结构蛋白NS1,ORF2全长2257 bp,能够编码结构蛋白VP1、VP2.经VP2氨基酸序列分析,鉴定其为New CPV-2b亚型,命名为CPV/HN1,该病毒分离株TCID50为10-4.85/0.1 mL,血凝效价为1:256.与国内的17株参考毒株全基因组序列核苷酸同源性为96.4% ~99.9%,其中与北京分离毒株同源性为99.9%.
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文献信息
篇名
犬细小病毒河南株的分离鉴定及全基因组序列分析
来源期刊
河南农业科学
学科
农学
关键词
犬细小病毒
分离鉴定
全基因组测序
序列分析
河南省
年,卷(期)
2019,(5)
所属期刊栏目
畜牧· 兽医
研究方向
页码范围
130-136
页数
7页
分类号
S855.3
字数
4208字
语种
中文
DOI
10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.05.019
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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魏战勇
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张楠
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全基因组测序
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河南省
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
河南农业科学
主办单位:
河南省农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-3268
CN:
41-1092/S
开本:
大16开
出版地:
郑州市农业路1号
邮发代号:
36-32
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
8734
总下载数(次)
17
总被引数(次)
59835
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