沼泽红假单胞菌16S rDNA PCR快速检测方法研究

• 作者: 王妍力 耿亚亚 郝葆青
• 来源期刊: 四川畜牧兽医
• 学科: 生物学
• 关键词: 沼泽红假单胞菌 16S rDNA 引物 PCR扩增 条件优化 诺卡氏菌属
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 20-22,25
• 页数: 4页
• 分类号: Q93-331|Q939.112
• 字数: 3185字
• 语种: 中文

摘要

目的：依据反映光合菌物种属性和高度保守性的16S rDNA序列，设计其特异性引物，优化并确定PCR反应条件，探索沼泽红假单胞菌快速鉴别的方法。方法：提取沼泽红假单胞菌菌体染色体DNA，分离和纯化；从GenBank分别获取假单胞菌属、大肠杆菌和诺卡氏菌属的16S rDNA基因序列，分析比较并确定其可变区的基因序列片段，设计种属特异引物；对影响PCR扩增的因素进行分析和预试，确定PCR扩增的最佳条件；随后进行PCR扩增试验，对其产物克隆测序，同时进行沼泽红假单胞菌形态特征和生化特性的检测。结论：以16S rDNA的种属特征序列设计引物，PCR扩增检测沼泽红假单胞菌样本的方法，特异强、灵敏度高、重复性好、操作性强、价格低廉；从分离提取样本DNA到完成PCR扩增，可在3 h左右对沼泽红假单胞菌作出鉴定。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郝葆青	西南民族大学生命科学与技术学院	43	157	7.0	10.0
2	王妍力	西南民族大学生命科学与技术学院	2	3	1.0	1.0
3	耿亚亚	西南民族大学生命科学与技术学院	5	4	1.0	1.0