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松墨天牛葡萄糖-6-磷酸异构酶基因克隆及序列分析
松墨天牛葡萄糖-6-磷酸异构酶基因克隆及序列分析
作者:
林同
蔡紫玲
陈敬祥
原文服务方:
南方农业学报
松墨天牛
葡萄糖-6-磷酸异构酶
克隆
生物信息学
摘要:
[目的]克隆松墨天牛(Monochamus alteratus)葡萄糖-6-磷酸异构酶(GPI)基因cDNA序列,探究其分子特征,为深入研究松墨天牛GPI的分子功能打下基础.[方法]采用RACE技术克隆松墨天牛GP基因cDNA序列,并对该序列及其编码氨基酸序列进行生物信息学分析.[结果]克隆并鉴定松墨天牛GPI基因,命名为MaGPI(GenBank登录号:KU323592),该基因序列长1038bp,共编码279个氨基酸.同源比对分析发现,松墨天牛与赤拟谷盗(Tribolium castaneum)的同源性最高,达90%,而与其他昆虫的同源性在76%以上.系统发育进化树分析结果表明,松墨天牛与赤拟谷盗在同一分支,与家蚕(Bombyx mori)相隔最远.MaGPI为亲水蛋白,含有5个功能位点:活性位点、变构位点、活性部位盖子和两个多肽结合位点.[结论]明确了MaGPI的核苷酸序列及编码蛋白特征,为进一步研究MaGPI的分子功能提供依据.
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文献信息
篇名
松墨天牛葡萄糖-6-磷酸异构酶基因克隆及序列分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
松墨天牛
葡萄糖-6-磷酸异构酶
克隆
生物信息学
年,卷(期)
2016,(5)
所属期刊栏目
植物保护·农业气象
研究方向
页码范围
657-661
页数
5页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j:issn.2095-1191.2016.05.657
五维指标
作者信息
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姓名
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1
林同
华南农业大学林学与风景园林学院
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蔡紫玲
华南农业大学林学与风景园林学院
8
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陈敬祥
华南农业大学林学与风景园林学院
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葡萄糖-6-磷酸异构酶
克隆
生物信息学
研究起点
研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
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