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海岛棉单萜合酶基因克隆及其受黄萎病诱导的表达分析
海岛棉单萜合酶基因克隆及其受黄萎病诱导的表达分析
作者:
孙全
杨璨
江怀仲
王微娜
耿帅鹏
蔡应繁
原文服务方:
南方农业学报
棉花
单萜合酶
GbTPS基因
黄萎病
实时荧光定量PCR
摘要:
[目的]克隆海岛棉品种新海15中单萜合成酶基因(GbTPS),研究其受黄萎病诱导的表达情况,为进一步研究该基因在棉花抗黄萎病中的功能打下基础.[方法]克隆Gb TPS基因的开放阅读框(ORF)全长序列,对其蛋白序列进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR及病毒诱导的基因沉默对其抗病性进行分析.[结果]通过PCR扩增得到一个全长为1761 bp的ORF序列,命名为Gb TPS(GenBank登录号:KP247548).生物信息学分析发现,该基因编码586个氨基酸,预测分子量为67.7 kD,等电点为5.79.系统进化树分析结果表明,GbTPS属于Tps-g亚家族.GbTPS基因经黄萎病菌诱导后,表达量在4~24h内显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于空白对照组.病毒诱导的基因沉默受黄萎病诱导后其病情指数为52.38,与对照组相比并无明显差异.[结论]GbTPS基因仅在棉花抗黄萎病的早期发挥积极作用.
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文献信息
篇名
海岛棉单萜合酶基因克隆及其受黄萎病诱导的表达分析
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
棉花
单萜合酶
GbTPS基因
黄萎病
实时荧光定量PCR
年,卷(期)
2016,(5)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子生物学
研究方向
页码范围
604-610
页数
7页
分类号
S562|Q344
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j:issn.2095-1191.2016.05.604
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
江怀仲
重庆邮电大学生物信息学院
27
105
6.0
8.0
2
孙全
重庆邮电大学生物信息学院
12
48
4.0
6.0
4
王微娜
重庆邮电大学生物信息学院
4
11
2.0
3.0
5
杨璨
重庆邮电大学生物信息学院
2
7
1.0
2.0
6
蔡应繁
河南大学棉花生物学国家重点实验室
4
26
2.0
4.0
9
耿帅鹏
河南大学棉花生物学国家重点实验室
1
6
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传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
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单萜合酶
GbTPS基因
黄萎病
实时荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43586
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南方农业学报2016年第11期
南方农业学报2016年第6期
南方农业学报2016年第5期
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