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摘要:
采用SMART技术构建了海岛棉黄萎病菌诱导下根全长cDNA文库,并进行了质量鉴定和EST序列分析.结果表明,文库的重组率为92.3%,库容量为1.1×106 pfu·mL-1,平均插入片段大于1.5kb.生物信息学分析表明该文库包含大量抗病调节基因和抗病防御基因.COG功能分类发现了多个参与信号转导、防御反应、细胞骨架以及次生代谢产物合成与分解等不同功能类别的基因成员.文库中出现的高丰度表达基因主要有病程相关蛋白(PR蛋白)、谷胱甘肽硫转移酶基因(GST)、亲环素蛋白、短链乙醇脱氢酶、抗坏血酸过氧化物酶及转录因子等.文库的构建为深入研究棉花抗黄萎病分子机制奠定基础.
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烟草
全长cDNA文库
表达序列标签
功能注释
内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 黄萎病菌诱导海岛棉全长cDNA文库构建及EST分析
来源期刊 棉花学报 学科 农学
关键词 海岛棉 黄萎病 cDNA文库 EST分析
年,卷(期) 2014,(3) 所属期刊栏目 研究简报
研究方向 页码范围 274-278
页数 5页 分类号 S562.032
字数 3342字 语种 中文
DOI
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研究主题发展历程
节点文献
海岛棉
黄萎病
cDNA文库
EST分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
棉花学报
双月刊
1002-7807
41-1163/S
大16开
河南省安阳市开发区黄河大道西段中棉所办公区
33-63
1974
chi
出版文献量(篇)
2011
总下载数(次)
0
总被引数(次)
29538
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导