甘蔗叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析

• 作者: 刘金仙 徐景升 袁照年 许莉萍 郑益凤 郭晋隆 阙友雄 陈如凯 陈平华
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗叶片 cDNA文库 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2009,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 843-850
• 页数: 8页
• 分类号: S188
• 字数: 5729字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.05.018

摘要

以甘蔗(Saechamm Complex)3个生长时期的功能叶片为材料,利用Oligo-capping法构建了一个甘蔗叶片全长cDNA文库.经鉴定该文库库容为3.0×106cfu,重组率为89%,全长率为85%,平均插入片段约为1 kb.利用该文库获得了228条5'端有效表达序列标签(EST).生物信息学分析表明,EST序列拼接出154个假定独立转录本(tentative unique transeript, TUT);NCBI同源比对分析表明,其中117条EST拼接的87个TUTs与已知功能基因具有较高的同源性,这些EST涉及细胞生长、信号转导、蛋白质合成、转录、抗逆反应、能量代谢等功能.