甘蔗茎全长cDNA文库构建及EST序列分析

• 作者: 刘金仙 许莉萍 郭晋隆 阙友雄 陈如凯
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗茎 全长cDNA文库 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 480-485
• 页数: 6页
• 分类号: S566.1
• 字数: 4548字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.03.016

摘要

在利用改进的Oligo-capping法构建1个高质量的甘蔗茎全长cDNA文库基础上,对该文库进行大规模测序,获得了283条5'端有效EST序列,平均长度为459 bp,经聚类和拼接获得204个假定独立转录本(TUTs),冗余序列所占比例27.9％.NCBI同源比对分析结果表明,其中132条EST拼接的103个TUTs与已知功能基因具有较高的同源性,结合拟南芥功能基因分类标准对这些TUTs进行分类,可分为12类,以参与蛋白质合成的基因最多,其次为细胞结构、蛋白质降解和贮藏、转录等类型的基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈如凯	福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室	125	1780	20.0	34.0
2	阙友雄	福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室	41	502	13.0	21.0
3	郭晋隆	福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室	24	210	9.0	13.0
4	许莉萍	福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室	59	686	15.0	23.0