基于钾离子通道开放的中药降压成分发现研究

• 作者: 张燕玲 李勇 李贡宇 蒋芦获 贺昱甦 陈茜
• 来源期刊: 中国中药杂志
• 关键词: 降压 钾离子通道开放剂 药效团 分子对接
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 药理
• 页码范围: 264-271
• 语种: 中文
• DOI: 10.4268/cjcmm20160217

摘要

该文以降压靶标膜ATP敏感钾通道(ATP-sensitive potassium channel,KATP)为研究对象,构建其基于配体和基于受体结构的药效团模型,并分别筛选中药化学成分数据库(traditional Chinese medicine database,TCMD),利用分子对接评价筛选结果,发现具有潜在KATP开放作用的中药降压活性成分.其中,基于配体的药效团模型(ligand based pharmacophore,LBP)以对人源KATP具有开放活性的48个化合物为研究对象,利用Hypogen模块进行构建,最优模型由1个氢键受体、1个氢键供体、1个疏水基团、1个芳香环和5个排除体积组成,预测训练集化合物活性相关系数为0.876 4,测试集相关系数为0.705 8,辨识有效性指数N为3.304,综合评价指数CAI为2.616;以KATP同源模建模型(PM0079770)为研究对象,构建基于受体的药效团模型(structure-based pharmacophore,SBP),最优模型具有6个氢键受体、8个氢键供体、7个疏水基团和18个排除体积,辨识有效性指数N为2.200,综合评价指数CAI为2.017.分别用2个最优模型对TCMD数据库进行筛选,对候选化合物进行Lipinski五规则及ADMET性质预测研究,LBP模型命中171个化合物,SBP模型命中178个化合物.利用分子对接技术分别对上述2组潜在中药活性成分进行评价,按照打分值由大到小的排序,分别选取对接pose个数的前3％为潜在活性化合物.得到由LBP模型虚拟筛选得到的10个化合物、由SBP模型虚拟筛选得到的2个化合物,共12个具有潜在KATP开放活性的中药成分.该研究为发现新的KATP开放剂提供了思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张燕玲	北京中医药大学中药信息工程研究室	90	652	14.0	20.0
2	李贡宇	北京中医药大学中药信息工程研究室	13	216	6.0	13.0
3	李勇	北京中医药大学中药信息工程研究室	33	64	3.0	7.0
4	贺昱甦	北京中医药大学中药信息工程研究室	10	80	5.0	8.0
5	陈茜	北京中医药大学中药信息工程研究室	7	33	3.0	5.0
6	蒋芦获	北京中医药大学中药信息工程研究室	1	2	1.0	1.0