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摘要:
目的:先天性心脏病(CHD)是环境因素和遗传因素共同作用的结果。室间隔缺损(VSD)是 CHD 中最常见的一种。研究表明,microRNAs(miRNAs)与 CHD 的发生发展关系密切,但目前缺乏有关 miRNAs 与 VSD 的研究报道。本研究旨在通过血清差异 miRNA 的表达研究阐明 miRNA 与 VSD 发生发展的关系。方法采用 miRNA表达谱芯片技术进行 VSD 患者血清 miRNA 表达差异分析,并对结果进行实时定量 PCR(Real-time PCR)验证,进而对 miRNA 调控的靶基因进行生物信息学分析。结果通过 miRNA 芯片在 VSD 患者和对照血清样本中检测 miR-NA 差异表达,筛选出36个表达差异的 miRNA(P <0.05),其中21个 miRNA 在 VSD 患者表达显著下调,15个表达显著上调。经过 Real-time PCR 验证,证实8个 miRNAs 差异表达有意义。通过生物信息学预测出447个靶基因,经 GO 分析富集度分值(enrichment score value)最大的生物过程(biological process)为心脏右心室形态发生(cardiac right ventricle morphogenesis),对应的差异表达基因为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3,调控这些基因的 miRNA可能包括 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433。结论通过微阵列技术分析和 RT-PCR 验证,筛选出8个差异表达 miRNA,为后续实验提供了可供分析的 miRNA。利用3个数据库及 GO 分析,发现 hsa-let-7e-5p、hsa-miR-222-3p 和 hsa-miR-433的靶基因分别为 NOTCH1、HAND1、ZFPM2和 GATA3,为进一步在基因水平研究 VSD 的发病机制提供了新的突破口,为将来可能实现的基因诊断、基因干预治疗以及疾病的预防奠定了一定的实验基础。
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文献信息
篇名 室间隔缺损患者循环 miRNA 表达差异研究
来源期刊 泰山医学院学报 学科 医学
关键词 室间隔缺损 微小 RNA NOTCH1 HAND1 ZFPM2 GATA3
年,卷(期) 2016,(9) 所属期刊栏目 论 著
研究方向 页码范围 961-967
页数 7页 分类号 R541.1
字数 5751字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1004-7115.2016.09.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 纪龙 泰山医学院公共卫生学院 18 52 5.0 6.0
2 王倩 泰山医学院公共卫生学院 9 20 3.0 3.0
3 李金栋 泰山医学院公共卫生学院 4 10 2.0 3.0
4 朱凯 泰山医学院公共卫生学院 5 9 2.0 2.0
5 吴雪嵩 泰山医学院公共卫生学院 3 6 1.0 2.0
6 许美玲 4 12 2.0 3.0
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研究主题发展历程
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微小 RNA
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研究起点
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泰山医学院学报
月刊
1004-7115
37-1199/R
大16开
山东省泰安市长城路
1979
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