铁皮石斛蔗糖转运蛋白基因的分离和表达分析

• 作者: 刘阿萍 张岗 李雪 杨文婷 邵庆庆 郭顺星
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 铁皮石斛 蔗糖转运蛋白 基因克隆 序列分析 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2016,（20）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3688-3695
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.20.022

摘要

目的 分离珍稀濒危药用植物铁皮石斛蔗糖转运蛋白(sucrose transporter,SUT)基因(DoSUT1)并进行生物信息学和表达模式分析.方法 采用RT-PCR和RACE技术获基因全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 6.0和MEGA 4.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助实时定量PCR检测基因表达模式.结果 分离到DoSUT1(GenBank注册号KF876842),cDNA全长1 920 bp,编码一条由538个氨基酸组成的多肽,相对分子质量57 400,等电点9.61;DoSUT1蛋白含12个跨膜域,具有高等植物蔗糖/H+共转运家族和协助扩散超家族的保守结构域(60-524、63-531);DoSUT1与多种植物SUT基因编码蛋白有较高的一致性,与玉米、大麦等单子叶植物SUT亚家族中的SUT4聚类在一起;DoSUT1基因具有组织表达特异性,其转录本在石斛叶和茎中表达量较高,分别为根中的2.783和2.150倍.结论 DoSUT1基因的分子特征为进一步研究其在铁皮石斛糖代谢调控中的作用奠定基础.