2010年-2013年宜春市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因进化分析

• 作者: 李健雄 熊英 陆红云 陈玉红 魏雄杰
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型H3N2亚型流感病毒 HA1基因 疫苗株
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 分子诊断与基因检测
• 页码范围: 394-396
• 页数: 3页
• 分类号: R373.1+3
• 语种: 中文

摘要

目的 掌握宜春市2010年-2013年甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因特征,了解WHO甲3型疫苗推荐株对宜春市甲3亚型流感病毒预防效果.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因后进行核苷酸序列测定,用DNAStar 5.0、BioEdit 7.0、Mega 3.1软件对测序结果进行分析处理.结果 对14株毒株进行HA1基因序列测定,分别与当年WHO对北半球推荐的疫苗株进行比对,2010年、2012年、2013年氨基酸同源性分别为98.6％ ～98.7％、99.2％～ 99.3％、98.4％～98.8％;氨基酸平均替换数分别为7.5个、5个、8.25个,2012年和2013年分别有2处和4处变异位于抗原决定簇,2010年未在抗原决定簇区发生氨基酸变异替换;14株所测甲型H3N2亚型流感病毒与当年疫苗推荐株均在同一分支上,亲缘性较近.结论 2010年-2013年甲型H3N2亚型流感病毒分离株HA1基因在不断发生变异,根据WHO不同年度推荐疫苗株生产的疫苗,对本市的甲型H3N2亚型流感保护效果良好.