基于高通量测序的牡蛎冷藏过程中微生物群落分析

• 作者: 刘淇 孟辉辉 曹荣 赵玲
• 来源期刊: 农业工程学报
• 学科: 工学
• 关键词: 微生物 冷藏 品质控制 牡蛎 细菌群落结构 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（20）
• 所属期刊栏目: 农产品加工工程
• 页码范围: 275-280
• 页数: 6页
• 分类号: TS254.1
• 字数: 5291字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11975/j.issn.1002-6819.2016.20.036

摘要

为揭示牡蛎冷藏过程中微生物群落结构的变化规律，采用高通量测序技术对冷藏0、4、8 d 牡蛎的菌群进行分析。结果表明高通量测序可以全面反映牡蛎中菌群的物种组成及丰度信息。牡蛎体附着的细菌以变形菌门（Proteobacteria）、γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）、弧菌目（Vibrionales）为主。在科的分类水平上，主要是弧菌科（Vibrionaceae）、希瓦氏菌科（Shewanellaceae）和交替假单胞菌科（Pseudoalteromonadaceae），其中初始样品以 Vibrionaceae为主，比例达36.8%；第4天样品 Pseudoalteromonadaceae 比例相对较高；第8天样品同样以 Pseudoalteromonadaceae 为主，而 Shewanellaceae 比例明显增加，达到19.5%。在属的分类水平上，在牡蛎初始菌群中比例前三位依次为弧菌属（Vibrio）、希瓦氏菌属（Shewanella）和交替假单胞菌属（Pseudoalteromonas），其中 Vibrio 在冷藏前期比例迅速下降；Shewanella 和 Pseudoalteromonas 在系统进化关系上较为接近，在冷藏后期比例占优，可能在牡蛎腐败过程中起到重要作用。研究结果可以为牡蛎的贮运保鲜策略提供参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹荣	中国水产科学研究院黄海水产研究所	63	764	17.0	26.0
2	刘淇	中国水产科学研究院黄海水产研究所	114	1371	22.0	31.0
3	赵玲	中国水产科学研究院黄海水产研究所	36	234	8.0	14.0
4	孟辉辉	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	59	3.0	3.0