龙眼胚性愈伤组织DRM1基因的 克隆及其定位与表达分析

• 作者: 吴晓佩 林玉玲 白玉 谢礼洋 赖钟雄 陈晓慧
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 龙眼 体胚发生 DlDRM1 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 2097-2105
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 5525字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2017.11.2097

摘要

该研究以龙眼胚性愈伤组织的转录组数据为基础,对龙眼胚性愈伤组织DlDRM1基因进行克隆和生物学信息分析,并检测其在体胚发生过程中不同发育阶段、不同浓度的外源激素(2,4-D、IAA、KT)处理下及不同组织部位的表达,以揭示DlDRM1基因在龙眼体胚发生过程中的功能.结果表明:(1)从龙眼转录组unigene序列筛选获得龙眼结构域重排甲基化酶1基因(命名为DlDRM1)全长序列,并利用RT-PCR法从'红核子'龙眼胚性愈伤组织中克隆获得DlDRM1基因的cDNA全长序列(GenBank登录号为KY990493);DlDRM1基因cDNA全长2574 bp,包括494 bp的5′U T R,184 bp的3′U T R,可编码包含631个氨基酸的蛋白质.(2)生物信息学分析显示,DlDRM1是一个不稳定的亲水蛋白,不含信号肽,不存在跨膜结构域,其分子式为C3104 H4839 N851 O984 S28;序列比对和系统进化分析表明,龙眼DlDRM1与脐橙DRM相似度最高(76.85%),二者亲缘关系也最为接近.(3)实时荧光定量PCR分析发现,DlDRM1在龙眼各组织器官中均有表达,且在果肉中表达量最高,其次是花蕾,在叶中的表达量最低;DlDRM1基因在非胚性愈伤组织中表达量最高,而且在非胚性愈伤向胚性愈伤转变过程中DlDRM1基因的表达量呈逐步下降趋势,说明DlDRM1基因与体胚胚性呈负相关关系,在龙眼体胚发生过程中可能发挥着重要的作用;一定浓度的IAA和2,4-D能够促进DlDRM1基因的表达,而KT则抑制DlDRM1的表达.(4)亚细胞定位结果表明,DlDRM 1定位于细胞核和细胞膜上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	林玉玲	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	148	560	10.0	16.0
3	陈晓慧	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	20	13	3.0	3.0
4	白玉	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	5	8	2.0	2.0
5	谢礼洋	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	7	11	2.0	2.0
6	吴晓佩	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	2	4	2.0	2.0