利用比较基因组学快速鉴定大肠埃希菌噬菌体耐受基因

• 作者: 孙强 安小平 童贻刚 米志强 赵宝华 赵飞扬 邢少贞
• 来源期刊: 中国抗生素杂志
• 关键词: 噬菌体 高通量测序 噬菌体受体 CRISPR 同源重组
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 噬菌体专辑
• 页码范围: 871-879
• 页数: 9页
• 分类号: Q939.48|R978.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8689.2017.10.010

摘要

噬菌体是解决致病菌多重耐药性问题的最佳选择之一,然而噬菌体的宿主特异性使得噬菌体的裂解谱有限,因此研究噬菌体宿主特异性对于噬菌体治疗应用具有重要意义.本研究通过筛选大肠埃希菌宿主菌BL21噬菌体IME253的耐受菌,结合对敏感菌和耐受菌的高通量测序,分析基因组差异,预测噬菌体耐受相关基因,发现耐受与外膜受体蛋白FepA有关.然后利用向导CRISPR/Cas9切开敏感菌epA基因,同时利用Red同源重组系统无痕敲涂fepA基因,证明fepA基因敲除可以导致细菌BL21对噬菌体IME253耐受.本实验利用比较基因组学分析平台,建立了一种宿主耐受噬菌体的分析方法,并且利用CRIPSR无痕敲除技术来验证耐受相关基因,为噬菌体治疗提供理论基础.