‘库尔勒香梨’自交不亲和S-RNase等位基因全长的克隆与分析

• 作者: 冯建荣 刘小芳 刘海楠 吕文娟 李文慧 钟颖
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 库尔勒香梨 自交不亲和 S-RNase基因 RACE
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 1639-1647
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.015.001639

摘要

‘库尔勒香梨’是新疆重点发展的特色果树品种之一,具有自交不亲和性.本研究以新疆轮台国家果树资源圃栽培梨品种‘库尔勒香梨’为试材,利用梨S基因的保守序列设计合成的引物:‘FTQQYQ’/‘anti-IIWPNV’初步确定‘库尔勒香梨’S-RNase等位基因型后,设计等位基因特异性引物,利用RT-PCR克隆两个花柱S-RNase等位基因cDNA片段,RACE (cDNA末端快速扩增)技术进行cDNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam等在线软件分析两个S-RNase等位基因的编码蛋白特性.根据NCBI上己登录的63条梨属S-RNase基因的全长序列,用DNAMAN软件对其氨基酸序列进行比对并用MEGA 4.0构建进化树.本试验从‘库尔勒香梨’中克隆得到了S22-RNase (GenBank接受号:KX214125)/S28-RNase (GenBank接受号:KX214124)等位基因cDNA的全长序列,为分子手段调控梨自交不亲和性状奠定了基础.S22-RNase基因cDNA全长904 bp,ORF(开放阅读框)长684bp,编码227个氨基酸;S28-RNase基因cDNA全长921 bp,ORF长687 bp,编码228个氨基酸.BLASTP比对显示,这两个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族.预测相对分子质量分别为25.6 kD和25.9 kD,等电点9.36和9.30,都属于亲水性蛋白.进化分析表明,‘库尔勒香梨’的S22-RNase和S28-RNase处在不同的两个分支上,表明两基因亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯建荣		41	230	8.0	13.0
2	吕文娟		1	0	0.0	0.0
3	刘小芳		3	4	1.0	2.0
4	刘海楠		2	0	0.0	0.0
5	李文慧		11	22	2.0	4.0
6	钟颖		1	0	0.0	0.0