枸杞自交不亲和基因S-RNase密码子偏性分析

• 作者: 戴国礼 段淋渊 焦恩宁 秦垦
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枸杞 密码子 偏好性 S-RNase 聚类分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 44-52
• 页数: 9页
• 分类号: S336
• 字数: 4210字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.swfu.201905085

摘要

为了掌握枸杞S-RNase密码子及其使用偏好性,利用EMBOSS和CodonW软件分析了枸杞S-RNase基因密码子的使用偏好性,并将其与酵母、大肠杆菌和柑橘等10种植物S-RNase基因密码子偏好性进行比对,结果表明:枸杞S-RNase密码子偏好以A/T结尾;RSCU值显示该基因高频率使用的密码子有9个,相较其他物种同源基因存在明显的密码子偏好性差异.此外,较密码子使用偏好性分析结果,基于S-RNase基因编码序列的聚类结果更能准确地反应物种之间的亲疏关系.比对其他物种该基因密码子的使用频率发现,同科物种差异较小,不同科物种差异较大;同时对比使用频率发现,枸杞S-RNase基因更适合导入酵母菌进行异源表达,但需要对其进行适当优化改造.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦垦	宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所	35	268	9.0	15.0
2	焦恩宁	宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所	21	157	8.0	11.0
3	段淋渊	宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所	8	3	1.0	1.0
4	戴国礼	宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所	23	64	5.0	6.0