金莲花叶绿体基因组密码子偏好性分析

• 作者: 李鸽 王娜玉 雷慧
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 金莲花 叶绿体 密码子偏好性 最优密码子
• 年，卷（期）: 2019,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1300-1305,1445
• 页数: 7页
• 分类号: S567.23+9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2019.08.02

摘要

对金莲花叶绿体基因组中筛选出的49条蛋白质编码序列(CDS)进行密码子使用偏好性(CUB)分析,为研究物种进化和外源基因表达提供依据.结果 表明,金莲花叶绿体基因的有效密码子数(ENC)在40.21～ 55.54波动,密码子的偏好性较弱;ENC与U3s、A3s呈极显著负相关,与G3s、GC3s呈极显著正相关,同义密码子第3位上的碱基含量直接影响密码子使用偏好性和基因的表达水平.相对同义密码子使用度(RSCU)分析发现,每种氨基酸的较优表达密码子RSCU均大于1且都以A或U结尾,最后确定9个密码子为金莲花叶绿体的最优密码子.通过与其他物种密码子使用频率的比较发现,酵母真核表达系统和双子叶模式植物拟南芥分别更适合金莲花叶绿体基因作基因表达和转基因研究的异源受体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷慧	忻州师范学院生物系	3	1	1.0	1.0
2	李鸽	忻州师范学院生物系	1	1	1.0	1.0
3	王娜玉	忻州师范学院生物系	1	1	1.0	1.0