二代测序技术检测不同环境下美洲大蠊 携带细菌的研究

• 作者: 单振菊 岳巧云 邱德义 陈健
• 来源期刊: 中国媒介生物学及控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 二代测序技术 美洲大蠊 细菌
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 543-549
• 页数: 7页
• 分类号: R384.9|R37
• 语种: 中文
• DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2017.06.007

摘要

目的 研究二代测序技术(NGS)在美洲大蠊携带细菌检测中的应用,建立一种可检测美洲大蠊体内、体表所携带未知种类细菌的方法,分析不同环境下美洲大蠊携带细菌情况及其与环境的关系.方法 2016年8-9月,以中山地区居民区、港口和医院环境中捕获的美洲大蠊为材料,对其16S rDNA V1~V9可变区分析,选取V3~V4可变区作为目的基因,利用NGS对其携带的细菌种类进行检测和分析.结果 港口、居民区和医院采集的美洲大蠊分别携带1564、1786和1779个运算分类单位;利用NGS分别可鉴定出细菌123属36种、131属42种和136属48种,细菌种类数超过传统方法.通过对样品进行物种多样性和聚类分析发现,同一环境下的样本无法完全聚集在一起.结论 16S rDNA V3~V4可变区适合对美洲大蠊体内、体表携带的细菌进行检测,利用NGS可一次性检出多种细菌;其检出的细菌种类远超出传统方法且操作简便;美洲大蠊携带细菌的种类与其生存环境无明显的区域特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳巧云	中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心	37	189	10.0	12.0
3	单振菊	中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心	9	19	2.0	4.0
4	邱德义	中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心	34	149	7.0	11.0
5	陈健	中山出入境检验检疫局检验检疫技术中心	8	36	4.0	6.0