23株不同地理来源嗜酸硫杆菌的系统发育及其遗传差异

• 作者: 倪永清 刘敏瑞 张敏 王爱英 蔺朋武
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 嗜酸硫杆菌 ITS序列 rep-PCR rus基因 遗传差异
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 560-570
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20160336

摘要

[目的]研究不同地理来源嗜酸硫杆菌的系统发育及其遗传差异,以及基因指纹图谱技术聚类与嗜酸硫杆菌地理来源的相关性.[方法]采用16S-23S rRNA间隔区(ITS)序列建立系统发育树,并结合ERIC和BOXAIR两种引物进行rep-PCR,以及rus基因扩增,对不同地理来源嗜酸硫杆菌进行分析.[结果]分离自不同样点的23株嗜酸硫杆菌遗传差异显著,依据ITS序列系统发育树被划分为5个大类群,与rep-PCR指纹图谱的分类结果较为接近,其中Acidithiobacillus ferrooxidans在ITS系统发育和BOXAIR-PCR指纹聚类分析中被划分为2个类群,但在ERIC-PCR中归为1个类群,rus基因分组中,在系统发育和聚类分析中处于同一类群的菌株拥有不同类型的rus基因,说明嗜酸硫杆菌的亚铁氧化途径与系统发育类群无明显相关性;ITS基因拥有区分近缘种或亚种的能力,且BOXAIR-PCR的分辨能力较强,非常适于嗜酸硫杆菌的遗传差异分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王爱英	石河子大学生命科学学院	43	228	9.0	12.0
2	倪永清	石河子大学食品学院	71	274	10.0	13.0
3	刘敏瑞	石河子大学食品学院	4	10	2.0	3.0
4	蔺朋武	石河子大学生命科学学院	3	5	1.0	2.0
5	张敏	石河子大学食品学院	9	63	4.0	7.0