黄绿卷毛菇开伞期上调基因的分析研究及验证

• 作者: 卢玉丽 秦日甜 谢占玲 郭璟
• 来源期刊: 青海大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 黄绿卷毛菇 开伞期 上调基因 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 农业科学
• 页码范围: 27-34
• 页数: 8页
• 分类号: S646.11
• 字数: 2806字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13901/j.cnki.qhwxxbzk.2017.05.005

摘要

为了解与黄绿卷毛菇生长发育相关基因的结构特征,探究其生长发育机制,完善其遗传背景.基于黄绿卷毛菇幼年期和开伞期的转录组测序结果,利用数据库对黄绿卷毛菇上调基因进行NR,NT注释,最后对测序结果进行荧光定量PCR验证.结果表明:经转录组测序结果分析得到196个上调基因,将其通过NR,NT数据库的注释,编码蛋白,预测蛋白,假定蛋白和未知蛋白分别占30.10％,28.06％,24.48％和17.35％.其中,31.28％的编码蛋白和31.25％的假定蛋白其基因序列长度为1 500～2000 bp,76.60％的未知蛋白其基因序列长度在1 500 bp以下;分别有47.50％,25.40％,25％的编码蛋白、预测蛋白及假定蛋白其相似度在80％～90％,仅有1.70％,1.80％,4.20％的编码蛋白、预测蛋白及假定蛋白其相似度在40％～50％;经荧光定量PCR验证的两个基因r6351,r7850均存在.该研究结果为完善黄绿卷毛菇子实体的形成机制提供了基因方面的数据支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢占玲	青海大学生态环境工程学院	33	414	9.0	20.0
2	秦日甜	青海大学生态环境工程学院	3	2	1.0	1.0
3	卢玉丽	青海大学生态环境工程学院	2	1	1.0	1.0
4	郭璟	青海大学生态环境工程学院	5	11	2.0	3.0