鸭MyoG基因启动子的生物信息学分析及其 甲基化频率对基因表达的影响

• 作者: 刘贺贺 吴乾锋 张涛 王继文 罗俊 胡博
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 肌细胞生成素 启动子 DNA甲基化
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 187-194
• 页数: 8页
• 分类号: S834.2
• 字数: 4899字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2017.02.014

摘要

采用RT–PCR技术扩增和克隆鸭MyoG基因启动子,并对其启动子序列进行生物信息学分析,采用Sequenom MassArray技术检测CpG岛在鸭肌肉组织中的甲基化水平,用qRT–PCR检测MyoG基因的表达量.结果表明,扩增得到鸭MyoG基因启动子序列2730 bp,对启动子序列预测后,发现存在2个CpG岛,其中CpG岛(–2536~–1997 bp)存在5个转录因子结合位点和多个真核生物结构元件.甲基化检测结果表明:在鸭的个体和组织水平上,启动子甲基化率均未聚类在一起;CpG位点甲基化频率存在个体差异,22%CpG位点的甲基化频率与MyoG的mRNA表达量呈负相关(P>0.05),78%CpG位点的甲基化频率呈正相关(P>0.05),其中,腿肌甲基化位点CpG_1、CpG_26.27.28.29的甲基化频率与MyoG基因表达水平均呈显著相关(P<0.05).MyoG基因在鸭与在哺乳动物中的转录调控机制存在差异.试验中发现多个影响鸭MyoG基因转录的潜在甲基化位点,其中CpG_1与CpG_26.27.28.29能通过DNA甲基化修饰影响MyoG基因在鸭腿肌中的转录.本研究结果可为鸭MyoG基因转录调控提供参考依据.