广州地区人巨细胞病毒临床低传代病毒株D<em>3</em>的UL147基因B细胞抗原表位的生物信息学分析

• 作者: 伍苑宾 晏翠芳 梁惠慈 王波 肖华 胡兢晶 苏海浩 谭琪琪 郭梦杰
• 来源期刊: 中国病毒病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 人巨细胞病毒 UL147基因 抗原表位 临床病毒株
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 191-196
• 页数: 6页
• 分类号: R373
• 语种: 中文
• DOI: 10.16505/j.2095-0136.2017.03.006

摘要

目的 应用生物信息学方法分析广州地区人巨细胞病毒(human cytomegalovirus,HCMV)临床低传代病毒株D3的UL147基因B细胞抗原表位.方法 应用生物信息学方法:用TMHMM预测跨膜区域,用改进型自我优化预测结构(SOPMA)、Garnier-Osguthorpe-Robson (GOR)法、人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,用Hopp&Woods亲水性方案、Janin可及性方案、Welling抗原性方案等参数预测UL147基因抗原表位.结果 临床低传代HCMV病毒株D3的UL147基因包含159个氨基酸残基,等电点为9.56;UL147存在一个跨膜区域,为20～ 42 aa区域,胞外区域为1～ 19 aa区域;无规则卷及β-转角区域主要位于12～ 17、22～ 28、31～48、99～109、130～145 aa区域;亲水性位于15～ 39、101～111、135～ 143 aa区域;可及性位于14～ 45、103～124、131～ 143 aa区域;抗原性位于9～14、63～70、108～116 aa区域.结论 临床低传代HCMV病毒株UL147基因抗原表位可能位于7～ 12 aa区域或其附近.