基于matK基因和ITS序列的江苏地方豆类植物的亲缘关系研究

• 作者: 刘静 杜建厂 王彤 袁娜 郭月
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 豆类植物 matK基因 ITS序列 亲缘关系 分化时间
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 795-803
• 页数: 9页
• 分类号: S643.1
• 字数: 6236字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201612040

摘要

[目的]为探究江苏地方豆类植物之间的亲缘关系,从分子水平上对14种豆科植物进行了深入分析,旨在为后续豆类植物的种质创新和遗传改良提供理论依据.[方法]对14种豆类植物的matK基因和ITS序列的扩增片段进行PCR产物直接测序,并结合GenBank数据库中的大豆(Glycine max)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、红小豆(Vigna angularis)和绿豆(Vignaradiata)4种豆类植物基因组序列,利用Clustal W、MEGA 6.0、BioEdit软件对这18种材料的matK基因和ITS序列分别进行比对和分析,并以百脉根(Lotus corniculatus)为外类群,分别构建系统进化树并计算分化时间.[结果]18种豆类植物的matK基因序列长度为750 bp,其中变异位点数为85,信息位点数为82,遗传距离的范围为0～ 0.099.ITS序列长度为795 bp,其中变异位点数为260,信息位点数为242,遗传距离的范围为0～0.292.以百脉根为外类群,用matK基因序列和ITS序列分别构建的进化树显示,18种豆类植物可分为3组,即红小豆和绿豆分为一组,菜豆和大豆分别聚为一组.分化时间结果表明,大豆与菜豆的分化时间为19.02百万年前,菜豆与红小豆的分化时间为13.50百万年前,绿豆与红小豆的分化时间为2.94百万年前.[结论]序列分析和系统进化树的结果与形态学的特征基本一致,表明matK基因和ITS序列可用于豆类植物属间亲缘关系分析.