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同位素标记相对和绝对定量技术在家族性瘢痕疙瘩蛋白质组学研究中的应用
同位素标记相对和绝对定量技术在家族性瘢痕疙瘩蛋白质组学研究中的应用
作者:
宗宪磊
祁佐良
蔡景龙
赵竞伊
靳小雷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
瘢痕疙瘩
增生性瘢痕
蛋白质组学
摘要:
目的 通过比较家族聚集性瘢痕疙瘩(FK)和散发性瘢痕疙瘩(SK)、增生性瘢痕(HS)、正常皮肤(NS)组织样本间蛋白质组表达的差异,筛选出与FK关系密切的蛋白,以期找到其特异性标志物,探索相关发病机制.方法 应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技术,对FK、SK、HS、NS 4组,每组6例样本,分别进行酶解、标记及串联质谱分析,进行分子生物学验证及生物信息学分析.并随机挑选2种差异蛋白以蛋白质印迹法进行验证.采用SPSS 16.O软件,用独立样本t检验对4组蛋白检测结果进行统计学分析,P<0.05为差异有统计学意义,筛选出变化倍数在1.2倍以上的差异蛋白.结果 测定到蛋白质共2 450种,其中各组间差异蛋白数量及情况:与NS相比,FK特异性表达上调的蛋白共250种,下调的蛋白有281种;SK中特异性表达上调的蛋白共281种,下调的蛋白有232种;HS中特异性表达上调的蛋白共199种,下调的蛋白有233种.与SK相比,FK特异性表达上调的蛋白共64种,下调的蛋白有164种;HS特异性表达上调的蛋白共79种,下调的蛋白有169种;与HS相比,FK特异性表达上调的蛋白共124种,下调的蛋白有115种.这些差异蛋白在细胞外基质、细胞黏附及生物代谢等多条重要信号转导通路中集中分布.蛋白印迹法验证结果表明2种差异蛋白(P3H1和RCN-3)变化趋势与iTRAQ技术检测结果相同.结论 iTRAQ技术能较好地显示瘢痕疙瘩、增生性瘢痕与正常皮肤组织间的蛋白质表达差异,将有助于揭示其发病机制,找到其特异性标志物用于诊断和治疗.
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文献信息
篇名
同位素标记相对和绝对定量技术在家族性瘢痕疙瘩蛋白质组学研究中的应用
来源期刊
中华整形外科杂志
学科
关键词
瘢痕疙瘩
增生性瘢痕
蛋白质组学
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
实验论著
研究方向
页码范围
122-128
页数
7页
分类号
字数
4151字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1009-4598.2017.02.010
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
宗宪磊
中国医学科学院整形外科医院整形十六科
21
96
5.0
9.0
2
靳小雷
中国医学科学院整形外科医院整形十六科
39
212
9.0
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3
祁佐良
中国医学科学院整形外科医院整形十六科
28
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赵竞伊
中国医学科学院整形外科医院整形十六科
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研究主题发展历程
节点文献
瘢痕疙瘩
增生性瘢痕
蛋白质组学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华整形外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-4598
CN:
11-4453/R
开本:
大16开
出版地:
北京市石景山区八大处路33号中国医学科学院整形外科医院
邮发代号:
18-95
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
5005
总下载数(次)
10
总被引数(次)
32948
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中华整形外科杂志2017年第3期
中华整形外科杂志2017年第2期
中华整形外科杂志2017年第1期
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