双特异性抗体杵臼结构的分子动力学研究

• 作者: 姬时宇 崔月倩 胡毅 赵磊 陈诗雪
• 来源期刊: 解放军医学院学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 双特异性抗体 杵臼结构 分子动力学
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 1155-1159,1173
• 页数: 6页
• 分类号: Q816
• 字数: 4235字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-5227.2017.12.017

摘要

目的 分析双特异性抗体杵臼结构(knobs-into-holes,KIH)的稳定性及异源重链二聚化的结合效率,为设计出更稳定的双特异性抗体奠定基础.方法 采用分子动力学模拟和泊松玻尔兹曼面积(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area,MM-PBSA)方法分析KIH结构的稳定性并计算结合自由能,将其与标准结构CH3野生型(wild-type,WT)进行对照比较,并通过SDS-PAGE和银染技术观察二者的结合效率.结果 在355 K温度下CH3 WT均方根偏差(root-mean-square deviation,RMSD)涨落小于1.0 (A),CH3 KIH波幅超过2.0 (A),主要是由于KIH knob部分3-27、45-52、70-80位氨基酸缺乏稳定性.WT和KIH中重链结合自由能分别为79.864 9 kJ/mol、107.008 2 kJ/mol,KIH的结合自由能更高,不利于两重链的结合.进一步计算结合面氨基酸结合能,找到了KIH中对结合作用贡献较小的10个氨基酸残基.银染观察KIH异源重链正确结合效率不足80％,远低于WT.结论 本研究发现双特异性抗体KIH结构的稳定性和重链结合效率均不如WT,并确定了KIH中缺乏稳定性和对结合作用贡献较小的氨基酸残基.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡毅	解放军总医院肿瘤内科	59	296	8.0	14.0
2	陈诗雪	解放军总医院肿瘤内科	2	4	1.0	2.0
3	姬时宇	解放军总医院肿瘤内科	6	22	3.0	4.0
4	赵磊	解放军总医院肿瘤内科	3	4	1.0	2.0
5	崔月倩	解放军总医院肿瘤内科	3	2	1.0	1.0