巴斯德杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立与初步应用

• 作者: 代解杰 冯育芳 孙晓梅 岳秉飞 贺争鸣 邢进
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 巴斯德杆菌 共有序列简并杂合寡核苷酸引物 PCR检测 实验动物
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 85-90
• 页数: 6页
• 分类号: R-332
• 字数: 3506字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969.j.issn.1671-7856.2017.01.017

摘要

目的 建立巴斯德杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为实验动物的呼吸道细菌的控制提供参考.方法 应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对Genbank中13株巴斯德杆菌的RNA聚合酶β亚基(rpoB)氨基酸序列设计简并引物.对建立CODEHOP PCR方法用21株参考菌株进行特异性和敏感性评价,并应用于实验动物中的巴斯德杆菌检测.结果 简并引物PastF6/PastR5扩增标准菌株的目的片段为200 bp左右.能够区分受试的巴斯德杆菌和主要的实验动物呼吸道病原菌.敏感性为0.2 pg/μL~2 pg/μL.在受试的609只实验动物中呼吸道样品中检测出巴斯德杆菌阳性率为19.1%.样品阳性片段经测序验证,准确率为100%.结论所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,可用于动物样品中巴斯德杆菌的检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳秉飞	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	117	385	11.0	14.0
2	贺争鸣	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	100	337	9.0	14.0
3	邢进	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	40	208	8.0	13.0
4	冯育芳	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	37	169	7.0	11.0