嗜血杆菌属CODEHOP PCR检测方法的建立及在树鼩检测中的应用

• 作者: 代解杰 冯育芳 孙晓梅 岳秉飞 贺争鸣 邢进
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 嗜血杆菌 CODEHOP PCR 树鼩 简并引物 检测
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 994-1000
• 页数: 7页
• 分类号: R378
• 字数: 4110字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2015.11.002

摘要

目的 建立树鼩中嗜血杆菌的CODEHOP PCR快速检测方法,为树鼩微生物质量控制提供参考.方法 应用CODEHOP在线简并引物设计工具,比对NCBI中6株嗜血杆菌的外膜蛋白序列设计简并引物.通过4株嗜血杆菌标准菌株和24株它属菌株进行特异性和敏感性评价,将建立CODEHOP PCR检测方法,应用于树鼩嗜血杆菌的检测.结果 简并引物HF1/HR8和HF3/HR3扩增标准菌株副鸡嗜血杆菌(ATCC 29545)、溶血嗜血杆菌(ATCC 33390)、流感嗜血杆菌(ATCC 33391)、副流感嗜血杆菌(ATCC 33392)的目的片段分别为506 bp～535 bp和344 bp～390 bp,经测序和NCBI Blast比对,结果准确.两对引物组合,能够有效的区分嗜血杆菌属菌株与它属菌株,检测限最低可达2.1 pg/μL.在受试的野生树鼩呼吸道样本中嗜血杆菌阳性率为33.3％(20/60).结论 所建立的方法具有较好的特异性和敏感性,操作简便,能够用于动物样品的嗜血杆菌检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳秉飞	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	117	385	11.0	14.0
2	贺争鸣	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	100	337	9.0	14.0
3	邢进	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	40	208	8.0	13.0
4	冯育芳	中国食品药品检定研究院实验动物资源研究所	37	169	7.0	11.0