2015年-2016年度南宁部分地区猪戊型肝炎病毒基因型分析

• 作者: 姚静 林思远 欧阳康 覃一峰 贺微 邹柳 陈樱 韦莹 黄加滨
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 基因型 猪
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 5-10
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6
• 字数: 3822字
• 语种: 中文

摘要

为了解广西猪群中戊型肝炎病毒(HEV)基因型,利用套式RT-PCR用对南宁周边猪场采集到的104份新鲜猪粪便进行HEV检测、分离并成功扩增和克隆了11株阳性毒株的ORF2基因部分保守片段.序列测定结果表明,11株HEV ORF2序列自身核苷酸同源性为97.7%~100%,推导编码的氨基酸同源性为97.9%~100%;与4型HEV代表毒株Ch-S-1、Ch-T11、swGX40等的核苷酸同源性为84.6%~90.6%,而与其他各型之间的同源性较低.系统发育进化树结果表明,11株HEV广西株为基因4型,其中,10株HEV为4a亚型,1株毒株为4e亚型.结果表明,广西猪群中流行的HEV均为基因4型,且以4a亚型为优势流行毒株.