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改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究
改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究
作者:
冯志山
张益
李贵霞
段素霞
王乐
赵梦川
马学军
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
叶酸
代谢
多态性,单核苷酸
聚合酶链反应
电泳,毛细管
DNA突变分析
DNA引物
摘要:
目的 建立改进的四引物扩增受阻突变体系PCR(T-ARMS-PCR)检测方法,实现单管一次性检测叶酸代谢过程相关的4个单核苷酸多态性(SNP)位点:rs1801133,rs1801131,rs1805087和rs1801394.方法 方法学建立.于2017年1至4月在河北省儿童医院检验科收集150名体检儿童抗凝全血标本以待验证.利用T-ARMS-PCR原理及多重嵌合引物策略设计rs1801133、rs1801131、rs1805087及rs1801394的特异性内外嵌合引物.通过优化引物浓度和反应条件,经单管PCR反应,结合QIAxcel毛细管电泳分析扩增产物长度,判读150份标本的SNP基因型,同时所有标本经测序法进一步验证.利用SPSS 17.0统计软件卡方检验对150份标本的4个SNP位点分别进行哈迪-温伯格遗传平衡(HWE)检测.结果 改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析的方法可在3 h内一次性识别本研究中叶酸代谢过程相关的4个SNP位点的8个不同等位基因,可对150份全血标本的SNP位点准确分型,其分型结果与测序法完全相符.4个SNP位点基因型的分布均符合HWE平衡定律(χ2rs1801133=0.69,Prs1801133=0.40; χ2rs1801131=0.21, Prs1801131=0.64; χ2rs1805087=3.32, Prs1805087=0.07;χ2rs1801394=1.91,Prs1801394=0.17).结论 本研究建立的改进的T-ARMS-PCR结合毛细管电泳分析方法,可准确地同时检测叶酸代谢过程相关的4个SNP位点,为指导人群特异性地补充叶酸提供了一种可能的技术手段.
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内容分析
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篇名
改进的四引物扩增受阻突变体系PCR方法同时检测叶酸代谢过程相关的四个单核苷酸多态性位点的研究
来源期刊
中华检验医学杂志
学科
关键词
叶酸
代谢
多态性,单核苷酸
聚合酶链反应
电泳,毛细管
DNA突变分析
DNA引物
年,卷(期)
2017,(10)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
799-804
页数
6页
分类号
字数
4171字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2017.10.013
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李贵霞
河北省儿童医院检验科
60
350
10.0
15.0
2
马学军
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
40
227
8.0
14.0
3
段素霞
河北医科大学研究生学院
3
10
2.0
3.0
4
赵梦川
1
1
1.0
1.0
5
王乐
1
1
1.0
1.0
6
冯志山
1
1
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7
张益
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
4
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传播情况
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引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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参考文献(0)
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节点文献
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华检验医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9158
CN:
11-4452/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-71
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
7229
总下载数(次)
38
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