HCV RNA阳性标本PCR-荧光探针法病毒亚型未检出原因分析

• 作者: 于艳华 侯玉丽 娄金丽 张立丽 赵艳 赵艳明 黄雁翔
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 丙型肝炎病毒 病毒基因型 病毒变异 病毒载量
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 临床检验技术研究
• 页码范围: 268-270
• 页数: 3页
• 分类号: R446.6
• 字数: 3122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2017.04.08

摘要

目的 探讨血清HCV RNA阳性,但PCR-荧光探针法病毒亚型检测未检出的原因.方法 收集2015年7月至2016年3月北京佑安医院临检中心分子室病毒载量＞1 000 IU/mL但未测出病毒亚型的标本55例,采用基因测序方法对病毒扩增产物进行分型分析.结果 55例HCV病毒载量＞1 000 IU/mL,但HCV病毒亚型未检出的标本中,其中3例为病毒载量接近病毒亚型检测下限,经测序分析为1b型2例,2a型1例;5例为检测试剂盒未覆盖亚型并且其探针位置无突变,HCV 1a型4例,6n型1例,占9.1％ (5/55);47例因探针序列位置基因突变导致病毒亚型未检出,占85.5％ (47/55),经测序发现其中1a型6例(6/47,12.8％),1b型32例(32/47,68.1％),2a型3例(3/47,6.4％),2b型1例(1/47,2.1％),3b型1例(1/47,2.1％),6a型2例(2/47,4.3％),1b、6q、6c混合型1例(1/47,2.1％),6n型1例(1/47,2.1％).探针序列位置基因突变组中以HCV病毒5'非翻译区(5'UTR) 204 C/T突变为主(31/47,66.0％),其次为5'UTR 168 C/A突变(5/47,10.6％).结论 病毒载量低、试剂盒覆盖的病毒亚型有限、探针对应的序列存在变异均会影响PCR-荧光探针法检测HCV基因型,其中探针序列变异是病毒亚型未测出的主要原因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵艳	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	80	352	9.0	16.0
2	张立丽	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	17	94	5.0	9.0
3	娄金丽	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	101	402	11.0	15.0
4	于艳华	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	49	217	8.0	13.0
5	黄雁翔	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	12	27	3.0	5.0
6	侯玉丽	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	9	31	2.0	5.0
7	赵艳明	首都医科大学附属北京佑安医院临检中心	5	9	1.0	3.0