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苦荞全生育期芦丁积累与其生物合成途径相关基因表达分析
苦荞全生育期芦丁积累与其生物合成途径相关基因表达分析
作者:
令狐斌
侯思宇
刘荣华
孙朝霞
杨武德
王丽
韩渊怀
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
苦荞
芦丁
MYB基因
基因表达
摘要:
[目的]探究苦荞全生育期芦丁含量变化与其合成途径关键酶基因和调控因子MYB基因表达量之间的相关性,以期进一步明确苦荞植株体内芦丁生物合成的分子机制.[方法]以九江苦荞为试验材料,整个生育期分别在萌发期、子叶期、真叶期、盛叶期、现蕾期、盛花期、灌浆期和籽粒成熟期共8个时期取材(S1—S8).采用RT-PCR方法,克隆获得与黄酮类代谢相关的MYB类转录因子基因.采用T-coffee软件进行氨基酸同源序列比对及保守结构域分析.与拟南芥黄酮类代谢相关的MYB转录因子及荞麦同源MYB转录因子序列比对,基于邻近法构建系统进化树;实时荧光定量PCR技术分析芦丁合成途径中5个关键酶FtCHS、FtF3H、Ft4CL、FtFLS-like和FtUFGT及上述克隆到的MYB转录因子在不同组织中的表达模式.基于高效液相色谱法(HPLC)测定全生育期取材组织的芦丁含量.同时采用相关性分析方法分析不同组织中芦丁含量变化与基因表达模式的相关性.转换上述数据为矩阵,采用欧式距离法构建共表达层次聚类图谱.[结果]克隆到2个MYB类转录因子,即FtMYB7和FtMYB9,其核酸序列长度分别为876和912 bp,分别编码291和303个氨基酸残基.氨基酸序列同源性比对分析结果表明,二者均具有典型的R2R3保守结构域,为R2R3类型的MYB转录因子.结合Nr数据库中17个苦荞和3个拟南芥黄酮类代谢相关MYB转录因子同源氨基酸序列构建系统进化树,结果表明这22个基因分成6大类群,其中FtMYB7属于第II类群,FtMYB9属于第IV类群,二者分属于不同类群,暗示这2个MYB转录因子可能涉及调控植物生长发育过程中不同功能类型.荧光定量结果显示,FtMYB7在S3(真叶期)和S5(现蕾期)基因相对表达量最高,达到501和867倍;FtMYB9在S1(萌发期)和S2(子叶期)相对表达量最高,分别为34和72倍.上述基因表达量与芦丁含量变化模式相关性分析表明,8个生长时期中,Ft4CL、FtCHS、FtF3H、FtUFGT和FtMYB7相对表达模式与芦丁含量变化幅度呈正相关,其相关系数分别为0.748、0.683、0.704、0.890和0.862.而FtFLS-like和FtMYB9与芦丁含量的变化幅度呈负相关,其相关系数分别为-0.442和-0.501.[结论]FtMYB7和FtMYB9转录因子在整个生育时期中表达模式存在明显差异.其中FtMYB7可能在苦荞芦丁积累的过程中起到正调控作用,而FtMYB9则为负调控作用.
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苯丙氨酸
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文献信息
篇名
苦荞全生育期芦丁积累与其生物合成途径相关基因表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
苦荞
芦丁
MYB基因
基因表达
年,卷(期)
2017,(18)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
研究方向
页码范围
3473-3481
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2017.18.004
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
杨武德
山西农业大学农学院
97
1082
19.0
29.0
2
王丽
山西农业大学农学院
12
84
4.0
9.0
3
侯思宇
山西农业大学农学院
16
42
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4
孙朝霞
山西农业大学农学院
19
64
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5
韩渊怀
山西农业大学农学院
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刘荣华
山西农业大学农学院
2
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令狐斌
山西农业大学农学院
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苦荞
芦丁
MYB基因
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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