苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析

• 作者: 令狐斌 侯思宇 刘荣华 孙朝霞 李红英 许冬梅 赵盖超 韩渊怀
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 苦荞 4-香豆酸辅酶A连接酶 电子克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 24-28
• 页数: 5页
• 分类号: Q781
• 语种: 中文

摘要

与其他作物相比,苦荞中含有较高含量的黄酮类物质—‘芦丁’.4-香豆酸—辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,EC 6.2.1.12)是植物苯丙烷代谢途径转向黄酮类物质代谢的关键酶之一.本研究利用已知的来源于‘九江苦荞’叶片的Ft4CL1 (HQ654088)基因片段为探针序列,从苦荞叶片转录组数据库中序列拼接得到一个苦荞Ft4CL全长基因,命名为Ft4CL(GenBank登录号:KM362863).生物信息学分析结果表明:该cDNA长度为2 007 bp,具有完整的ORF,共1 743 bp,编码580个氨基酸,具备4CL所有活性位点.与已公布的部分Ft4 CL基因及蒺藜苜蓿(Pb4CL)、甜瓜(Cm4CL)和黄瓜(Cs4CL)基因相似度为100％、73％、73％和72％.遗传聚类结果显示,该基因归类于双子叶植物.研究结果为深入探讨苦荞黄酮代谢途径提供了基础,也为提高苦荞黄酮含量提供了定向靶基因.