玫瑰根系AMF 18S rRNA基因克隆文库构建及分析

• 作者: 任禛 夏体渊 尹利方 尹敏 王定康 陈泽斌 靳松 韩丽
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玫瑰‘卡罗拉’ 丛枝菌根真菌 克隆文库 系统发育树 评价和分析
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺·烟草科学
• 页码范围: 2113-2118
• 页数: 6页
• 分类号: S641.2
• 字数: 2660字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2017.9.032

摘要

[目的]本文研究了玫瑰根系的AMF多样性和组成结构.[方法]从昆明学院种质资源圃随机采集玫瑰‘卡罗拉’3株,采用CTAB法提取根系DNA,运用巢式PCR扩增AM真菌部分18S rRNA基因区域,扩增产物混合后构建克隆文库,最终确定30个阳性克隆子测序,并对文库进行评价和分析.[结果]文库Coverage C值为80％,但Rarefaction曲线不够饱和,应加大文库克隆子数目;文库多样性参数香农指数和辛普森指数分别为1.432和0.25,物种丰富度为4.0;以98％为界,30条序列被划分为15个OTU,均为Glomus的种类;其中OTU1是文库中的主要类型,OTU2～ OTU9代表了常见类型,而OTU10 ～OTU15为稀有类型;有10个OTU在系统进化树上单独聚类,代表着Glomus较为新颖的种类.[结论]在玫瑰根系发现的15个OTU全为Glomus的种类,其中主要类型1种,常见类型8种,稀有类型6种,具体分类地位均不清楚.