2014-2015年北京市房山区H3N2亚型流感病毒基因特性

• 作者: 刘海波 刘颖 史文凤 王云霞 阚震 黄少平
• 来源期刊: 职业与健康
• 学科: 医学
• 关键词: H3N2型流感病毒 基因测序 进化树
• 年，卷（期）: 2017,（17）
• 所属期刊栏目: 实验·监测与检验
• 页码范围: 2345-2348
• 页数: 4页
• 分类号: R181.3
• 语种: 中文

摘要

目的 了解北京市房山区2014-2015年H3N2亚型流感病毒HA1基因变异情况.方法 随机分别选择2014-2015年流感病原学监测中分离到的H3N2型毒株共26株,采用RT-PCR法扩增病毒目的基因片段后进行序列测定,与WHO推荐的北半球疫苗株及常见H3N2毒株进行比对并构建进化树.采用MEGA6软件对测序结果进行分析,同源性计算使用BLAST网站,利用NetNGlyc 1.0软件进行糖基化位点预测.结果 2014-2015年房山区H3N2亚型流感病毒HA1目的基因片段序列测定拼接后最长核苷酸片段为703 bp最短核苷酸片段为696 bp,没有核苷酸的丢失,编码氨基酸为232-234个;抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异;受体结合位点第228位由丙氨酸变为丝氨酸,第130位由丝氨酸变为苏氨酸;做进化树分析,发现该分析中的H3N2亚型流感病毒位于2个分支上,分别为A/Switzerland/9 715 293/2013和A/HongKong/5 738/2014,大部分与前者在一个分支.结论 北京市房山区2014-2015年H3N2流感病毒的血凝素重链区HA1基因特性有部分变化,抗原表位A抗原表位和D抗原表位有变异,且在基因进化上与当年的疫苗株分属不同分支,具有一定的进化距离,相似度较低,可能导致H3N2流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘颖	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	12	13	2.0	3.0
2	黄少平	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	55	204	8.0	10.0
3	史文凤	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	15	35	4.0	5.0
4	阚震	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	45	161	7.0	9.0
5	刘海波	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	13	21	3.0	4.0
6	王云霞	北京市房山区疾病预防控制中心微生物检验科	9	18	3.0	4.0