遗传进化分析在广东省一起HCV“暴发流行”事件中的应用

• 作者: 安玉玲 胡建兰 邹霁
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 关键词: 丙型肝炎病毒 暴发 进化分析 基因序列
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 调查研究
• 页码范围: 1174-1178
• 页数: 5页
• 字数: 3117字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2017.07.042

摘要

目的:通过对广东省一起丙型肝炎病毒(HCV)“暴发流行”事件进行遗传进化分析来了解此次事件的起源时间和传播源头.方法:首先对“暴发流行”事件调查中的192例血清样本作为研究组进行基因分型,得到2a亚型和6a亚型,选取相应基因亚型的对照组样本,采用生物信息学相关软件进行遗传进化分析,通过构建的时间尺度树推断此次HCV可能的起源时间及传播源头.结果:此次“暴发流行”事件的192例患者中,66例为2a亚型,119例为6a亚型,未发现其它的基因亚型.对2a亚型数据集以及6a数据集分别进行遗传进化分析提示两者都主要起源于2～5年前,均符合医源性感染的特点.结论:此次广东省HCV“暴发流行”事件中HCV主要基因型为2a和6a,主要起源于2～5年前,符合医源性传播特点,随着时间的延长积累了众多病例导致“暴发”.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹霁	中山大学附属第三医院感染科	2	3	1.0	1.0
2	胡建兰	中山大学附属第三医院感染科	4	8	2.0	2.0