乌头萜类生物合成代谢的转录组学分析

• 作者: 张大燕 彭成 文欢 王伟 高继海
• 来源期刊: 中国实验方剂学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乌头 转录组 萜类化合物 次级代谢生物合成
• 年，卷（期）: 2017,（16）
• 所属期刊栏目: 资源与鉴定
• 页码范围: 45-50
• 页数: 6页
• 分类号: R282.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.2017160045

摘要

目的:对乌头的6个器官组织,主根、侧根、茎、叶、花、果实进行转录组测序分析,以研究参与其萜类次级代谢生物合成相关基因的表达谱,挖掘其功能基因.方法:采用Illumina HiSeq 2500平台测序、组装得unigenes,与公共数据库NR,Swiss-Prot,GO,COG,KOG,KEGG比对、注释以获得差异基因,使用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)验证参与萜类次级代谢生物合成的关键基因.结果:本研究共获得156 967 635条Clean Reads(28 254 174 300 bp),经序列合并拼接后获得103 337个unigenes,通过核苷酸和蛋白序列等方面的同源性分析,表明其中37.31％(38 554个unigenes)与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性,通过功能分类研究和代谢途径分析(KEGG)获得参与萜类合成158个unigenes(编码5个关键酶).结论:这些发现的基因将为乌头萜类化合物的生物合成途径及分子机制提供基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭成		309	2724	26.0	38.0
2	王伟		5	22	2.0	4.0
3	高继海		8	27	3.0	5.0
4	文欢		3	0	0.0	0.0
5	张大燕		3	0	0.0	0.0