茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析

• 作者: 张玥 胡雲飞 王树茂 柯子星 林金科
• 学科: 农学
• 关键词: 儿茶素 MYB转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 页码范围: 162-173
• 页数: 11页
• 分类号: S571.1,Q946.8
• 语种: 中文

摘要

从茶树（Camellia sinensis）转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子，对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析，通过同源分析构建系统发育树。结果表明，与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白，定位在叶绿体、线粒体和细胞核上，其空间结构主要是α-螺旋和β-转角；保守结构域的分析发现除了comp159173_c0基因，其余5个都属于SANT超家族基因成员。系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支，显示出各自间较远的亲缘关系。差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性。