变异链球菌UA159细胞壁蛋白的预测和功能分析

• 作者: 刘向东 卢伟 姚嘉 张跃华 朱德全 栾积毅 郝莹莹 韩诚武
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 变异链球菌 基因组 细胞壁蛋白 功能
• 年，卷（期）: 2017,（19）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 121-122
• 页数: 2页
• 分类号: S188+.2
• 字数: 1637字
• 语种: 中文

摘要

[目的] 对变异链球菌UA159细胞壁蛋白进行预测和功能分析,为后续研究该菌致病机制奠定基础.[方法] 用Phobius和SignalP 4.0软件预测变异链球菌UA159的细胞壁蛋白,并采用COG功能数据库对细胞壁蛋白进行功能注释.[结果] 变异链球菌UA159共含有 22个细胞壁蛋白,其中含有LPxTG锚定基序的有12个,含有LysM基序的有3个,含有CW基序的有5个,含有GW基序的有1个,含有PG锚定基序的有1个.功能分析结果显示,22个细胞壁蛋白中有18个蛋白没有具体的功能注释,4个蛋白有具体的功能注释,其中 beta-lactamase与防御机制功能有关;exo-beta-D-fructosidase与碳水化合物代谢与转运有关;分子伴侣蛋白ATP-dependent protease ClpE与蛋白质翻译后修饰和蛋白质折叠有关;cell wall-associated protein WapA与细胞壁和细胞膜的生物合成有关.[结论] 变异链球菌UA159全基因组大多数的细胞壁蛋白功能未知,需在以后研究中进行进一步的功能注释.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚嘉	佳木斯大学机械工程学院	43	152	5.0	10.0
2	卢伟	佳木斯大学机械工程学院	43	201	7.0	12.0
3	栾积毅	佳木斯大学机械工程学院	37	105	5.0	8.0
4	张跃华	佳木斯大学理学院	103	364	8.0	15.0
5	朱德全	佳木斯大学理学院	65	156	7.0	9.0
6	韩诚武	佳木斯大学生命科学学院	34	65	5.0	6.0
7	刘向东	佳木斯大学机械工程学院	42	155	7.0	10.0
8	郝莹莹	佳木斯大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0