PRRSV HuN-2011株ORF5和ORF7基因的序列分析

• 作者: 徐静伟 曹宗喜 田语诗 谭树义 贺冬梅 陈朝喜 魏玉情
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV) HuN-2011株 ORF5 ORF7 序列分析 基因缺失
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 兽医科学
• 页码范围: 188-191
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

为了解猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的遗传进化特点,试验采用RT-PCR技术,扩增PRRSV HuN-2011株的ORF5和ORF7基因,并对其进行序列测定,利用生物信息学软件进行遗传进化分析.结果表明:PRRSV HuN-2011株属于美洲型变异株,其ORF5和ORF7与EF112447 HEB1、JX235370 11GZ-GD、KF751237 BJ1102O、KJ546412 HeNan-A9、GQ359108 SD-CXA-2008等PRRSV变异株等位基因核苷酸的相似性分别为95.0％～96.4％、97.0％～99.5％,推导氨基酸的相似性分别为83.6％ ～91.5％、98.4％～100％;与经典毒株AY262352 HB-2(sh) 2002核苷酸的相似性为90.4％、93.5％,推导氨基酸的相似性为94.5％、91.9％;与两株美洲型经典毒株VR-2332核苷酸的相似性为87.4％和86.7％、94.4％和93.8％,推导氨基酸的相似性为88.6％和94.5％、96.0％和95.2％;进化树分析表明,HuN-2011株与JX235370 11GZ-GD的遗传距离最近,与经典毒株AY262352 HB-2 (sh) 2002和EF536003 VR2332属于同一亚群,但与欧洲型GU73726407V063和GU067771 Amervac PRRS属于不同亚群.说明HuN-2011株为美洲型变异株.