MDRV-YB株σNS蛋白结构与功能的生物信息学分析

• 作者: 吴宝成 吴异健 周五朵 孙彤 朱二鹏 李安菊 林绍青 郑玲红
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 番鸭呼肠孤病毒(MDRV) σNS蛋白 基因克隆 序列测定 结构与功能 生物信息
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 兽医科学
• 页码范围: 177-181,294
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65+7|O78
• 语种: 中文

摘要

为了获取番鸭呼肠孤病毒(MDRV) YB株σNS蛋白结构与功能的相关生物学信息,试验通过克隆测序获取MDRV-YB株σNS基因序列,并运用相关生物信息学软件对σNS蛋白结构与功能进行生物信息学分析.结果表明:MDRV-YB株σNS蛋白的编码区大小为1 104 bp,编码367个氨基酸,为亲水性不稳定蛋白,具有4个N-糖基化位点、3个O-糖基化位点、28个磷酸化位点,但不舍潜在的信号肽序列;二级结构分析显示,d-螺旋结构、β-折叠结构、β-转角结构、无规卷曲的氨基酸残基分别占40.2％、42.1％、8.97％和8.97％;推导氨基酸序列的遗传进化树分析显示,MDRV-YB株与传统型MDRV的遗传进化关系较近,与新型MDRV及鸡源呼肠孤病毒(CRV)遗传进化关系较远.说明σ-NS蛋白作为非结构蛋白参与病毒的复制过程,且具有较高的保守性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴异健		42	134	8.0	10.0
2	吴宝成		42	507	11.0	22.0
3	周五朵		12	15	2.0	3.0
4	朱二鹏		13	8	1.0	2.0
5	孙彤		3	3	1.0	1.0
6	郑玲红		3	7	1.0	2.0
7	李安菊		1	0	0.0	0.0
8	林绍青		4	0	0.0	0.0