TCF3-PBX1阳性急性淋巴细胞白血病相关基因的筛选及生物信息学分析

• 作者: 华建媛 李振江 石庆之 郑积富 陈丽娜
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 医学
• 关键词: 急性淋巴细胞白血病 TCF3-PBX1 R编程语言 基因芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 376-379
• 页数: 4页
• 分类号: R557.4
• 字数: 3446字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2017.03.028

摘要

目的 研究比较TCF3-PBX1阳性和阴性急性淋巴细胞白血病基因表达的差异,并寻找在特定类型白血病的发生、发展过程中起重要作用的基因,为临床诊疗提供新思路.方法 在公共基因芯片数据库GEO中下载GSEl1877数据集,利用R编程语言,应用贝叶斯检验和倍比法(fold change)筛选差异表达基因(校正P＜0.05,并且log2 (fold change)＞2).利用DAVID数据库进行生物学过程功能富集分析.结果 共获得207个数据集,其中TCF3-PBX1阳性组23个,阴性组184个,最终汇总获取2 890个基因的表达水平,其中27个符合条件的差异基因被选出,这些基因的功能大致分为细胞骨架结构、细胞信号转导、转录调控、细胞黏附、细胞凋亡等.功能富集分析显示BANK1、GAB1、ZAP70等8个基因在TCF3-PBX1阳性白血病发生、发展过程中可能起到关键作用.结论 利用生物信息学方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,TCF3-PBX1阳性白血病的发生是由于多种基因表达改变所致,为确定其早期诊断标志与新治疗靶位提供了新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石庆之	南昌大学第二附属医院血液内科	49	166	7.0	10.0
2	华建媛	南昌大学第二附属医院血液内科	20	90	4.0	8.0
6	李振江	南昌大学第二附属医院血液内科	19	77	4.0	8.0
10	陈丽娜	南昌大学第二附属医院血液内科	7	19	3.0	4.0
19	郑积富	南昌大学第二附属医院血液内科	2	2	1.0	1.0